La nova línia de llum XAIRA, dedicada a la cristal·lografia macromolecular de microfocus, ha aconseguit una fita important aquest any a l'entrar en operació regular per a usuaris al juny. Des que va obrir les portes a la comunitat de biologia estructural, XAIRA ha demostrat ràpidament el seu valor com a instrument d'alt rendiment per a projectes complexos en cristal·lografia. En només uns mesos d'activitat, en paral·lel a les darreres fases de posada en marxa de la línia de llum, s'han lliurat gairebé 80 torns experimentals als usuaris, que han recopilat dades de difracció d'una àmplia gamma de mostres cristal·lines. Aquest reeixit inici reflecteix la confiança dels usuaris a XAIRA com una línia de llum fiable que facilita la seva investigació estructural d'avantguarda.

Un èxit particularment significatiu es va produir la setmana passada, quan una nova estructura de proteïna determinada a partir de dades recopilades a XAIRA es va dipositar al Banc de Dades de Proteïnes (PDB de Protein Data Bank en anglès). L'estructura dipositada sota l'identificador PDB 9TJX representa la primera entrada al PDB derivada de dades d'usuari recopilades a XAIRA. Tot i que l'estructura està en suspens i, per tant, encara no s'ha publicat, s'espera que l'article científic que la descriu es publiqui properament, fet que marca un resultat científic clau de la fase operativa inicial de XAIRA.

L'autor principal d'aquesta investigació és Jacinto López Sagaseta, Director de la Unitat de Cristal·lografia de Proteïnes i Immunologia Estructural de Navarrabiomed (Pamplona). El seu grup compta amb una àmplia experiència en estudis estructurals de proteïnes implicades en l'hemostàsia i la regulació immunitària, i aquesta nova estructura aborda una qüestió àmpliament estudiada en el camp de la biologia de la coagulació.

L'estudi aborda la base estructural de la interacció entre el factor VII activat recombinant (rFVIIa), un agent terapèutic clau per controlar el sagnat greu en pacients hemofílics, i el receptor de proteïna C endotelial (EPCR). Tot i que se sabia que l'EPCR s'uneix a FVIIa, la manca d'informació estructural havia limitat la comprensió del mecanisme molecular subjacent a aquesta interacció i la seva rellevància fisiològica i farmacològica durant el tractament amb rFVIIa.

Usant cristal·lografia de raigs X, els autors van determinar l'estructura del domini Gla del FVII unit a MPCR, revelant que el FVIIa i la proteïna C competeixen pel mateix lloc d'unió a l'EPCR mitjançant un mecanisme d'acoblament conservat, depenent del domini Gla. Aquesta troballa estableix l'EPCR com un receptor genuí per a FVIIa, reverteix la visió que l'EPCR està restringit a la unió de la proteïna C/APC i proporciona una explicació estructural de com l'rFVIIa pot influir en l'activació de la proteïna C durant la teràpia de l'hemofília.

La línia de llum XAIRA, amb el feix de raigs X altament enfocat de 4 × 6 µm² (que s'espera que arribi a la mida nominal de 3 × 1 µm² després d'una nova posada a punt) i el detector Eiger2 XE 9M d'alta velocitat de fotogrames i baix soroll, està especialment dissenyada per permetre la recopilació eficient de dades de cristalls molt petits o no homogenis. A més, cal destacar que està previst entrar en funcionament amb una atmosfera d'heli a principis del proper any, cosa que contribuirà encara més a reduir la dispersió del fons i proporcionar imatges de difracció més netes per a microcristalls i mostres que tenen una difracció feble. També s'implementarà la configuració de cristal·lografia serial d'objectiu fix per a experiments a temperatura ambient a mitjans del 2026.

Més enllà de la importància biològica, aquesta primera deposició de PDB basada en dades d'usuaris de XAIRA s'erigeix com una evidència clara de les capacitats i l'impacte científic de la línia de llum. A mesura que XAIRA continua donant suport a una comunitat d'usuaris en expansió, s'espera que es produeixin més estructures d'alta qualitat i coneixements biològics importants, reforçant el paper com a instrument clau per a la comunitat de biologia estructural a Espanya i a l'estranger.